O Kuressaare é o aeroporto principal em que a NyxAir opera. O Tallin Ulemiste e o Kardla também são aeroportos populares que a NyxAir utiliza regularmente.
Para conheceres o estado de qualquer voo da NyxAir, usa o Monitorizador de voos. Basta introduzires o nome de um aeroporto ou número de voo e clicar em Monitorizar voo para receberes atualizações como horas de partida e chegada ou números de porta e terminal. Também podes receber atualizações acerca do estado de um voo diretamente da NyxAir, ao ligar para o +372 634 7236 ou no site da companhia (flynyx.com).